Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RTEL1Q9NZ71 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTEL1Q9NZ71 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTEL1Q9NZ71 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms