Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CNTLNQ9NXG0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CNTLNQ9NXG0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CNTLNQ9NXG0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CNTLNQ9NXG0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CNTLNQ9NXG0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms