Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA3Q9NST1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms