Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLBQ9NRJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAPOLBQ9NRJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPOLBQ9NRJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms