Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1Q9NPL8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms