Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHS2Q9NP85 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHS2Q9NP85 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHS2Q9NP85 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHS2Q9NP85 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHS2Q9NP85 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHS2Q9NP85 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHS2Q9NP85 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHS2Q9NP85 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHS2Q9NP85 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPHS2Q9NP85 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPHS2Q9NP85 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPHS2Q9NP85 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms