Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLMPQ9H6B4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLMPQ9H6B4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLMPQ9H6B4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms