Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRMDAQ9H2I8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRMDAQ9H2I8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRMDAQ9H2I8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms