Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCLK3Q9C098 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCLK3Q9C098 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCLK3Q9C098 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms