Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHID1Q9BWS9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHID1Q9BWS9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHID1Q9BWS9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms