Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC106Q9BWC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC106Q9BWC9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC106Q9BWC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC106Q9BWC9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms