Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00052Q96N35 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00052Q96N35 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00052Q96N35 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms