Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PABPC5Q96DU9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC5Q96DU9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPC5Q96DU9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms