Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBLCP1Q8WVY7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBLCP1Q8WVY7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBLCP1Q8WVY7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBLCP1Q8WVY7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms