Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU79

SMAP2, Stromal membrane-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAP2Q8WU79 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAP2Q8WU79 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAP2Q8WU79 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAP2Q8WU79 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAP2Q8WU79 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAP2Q8WU79 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAP2Q8WU79 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms