Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3IL1Q8TBN0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3IL1Q8TBN0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3IL1Q8TBN0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms