Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF397Q8NF99 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF397Q8NF99 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF397Q8NF99 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms