Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
LGI3Q8N145 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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LGI3Q8N145 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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LGI3Q8N145 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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LGI3Q8N145 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LGI3Q8N145 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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LGI3Q8N145 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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LGI3Q8N145 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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LGI3Q8N145 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGI3Q8N145 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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LGI3Q8N145 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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LGI3Q8N145 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGI3Q8N145 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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LGI3Q8N145 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGI3Q8N145 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGI3Q8N145 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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LGI3Q8N145 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGI3Q8N145 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LGI3Q8N145 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LGI3Q8N145 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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