Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFNL1Q8IU54 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IFNL1Q8IU54 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IFNL1Q8IU54 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms