Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
METAP1DQ6UB28 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
METAP1DQ6UB28 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
METAP1DQ6UB28 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
METAP1DQ6UB28 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms