Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C19orf48Q6RUI8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C19orf48Q6RUI8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C19orf48Q6RUI8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms