Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAVIN1Q6NZI2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAVIN1Q6NZI2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CAVIN1Q6NZI2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms