Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTL6Q6ICC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTL6Q6ICC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTL6Q6ICC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms