Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNS3Q68CZ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TNS3Q68CZ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNS3Q68CZ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms