Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QL3Q5VWW1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QL3Q5VWW1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QL3Q5VWW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1QL3Q5VWW1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QL3Q5VWW1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms