Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2LQ5T4T6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2LQ5T4T6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2LQ5T4T6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms