Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC23Q53EV4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC23Q53EV4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC23Q53EV4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC23Q53EV4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms