Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGAP29Q52LW3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARHGAP29Q52LW3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGAP29Q52LW3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP29Q52LW3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms