Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms