Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBR1Q16650 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBR1Q16650 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBR1Q16650 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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