Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACKR1Q16570 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACKR1Q16570 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR1Q16570 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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