Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFDHQ16134 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ETFDHQ16134 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFDHQ16134 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFDHQ16134 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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