Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAM1Q15629 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAM1Q15629 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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