Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF9Q13886 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF9Q13886 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF9Q13886 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms