Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL3Q13618 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL3Q13618 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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