Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms