Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDR1Q08345 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDR1Q08345 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
DDR1Q08345 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1674.2 ms