Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TLE4Q04727 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TLE4Q04727 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TLE4Q04727 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLE4Q04727 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 884.2 ms