Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63121 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113P63121 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63121 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63121 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms