Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42P60953 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42P60953 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42P60953 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42P60953 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42P60953 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42P60953 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42P60953 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42P60953 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42P60953 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42P60953 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42P60953 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42P60953 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42P60953 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42P60953 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42P60953 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42P60953 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42P60953 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42P60953 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42P60953 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42P60953 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42P60953 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42P60953 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42P60953 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42P60953 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42P60953 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42P60953 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42P60953 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42P60953 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42P60953 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42P60953 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42P60953 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42P60953 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42P60953 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42P60953 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42P60953 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42P60953 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42P60953 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42P60953 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42P60953 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42P60953 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42P60953 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42P60953 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42P60953 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC42P60953 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42P60953 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42P60953 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42P60953 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42P60953 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42P60953 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42P60953 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42P60953 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42P60953 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42P60953 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42P60953 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42P60953 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42P60953 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42P60953 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42P60953 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42P60953 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42P60953 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC42P60953 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42P60953 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42P60953 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42P60953 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42P60953 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42P60953 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC42P60953 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC42P60953 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42P60953 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42P60953 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42P60953 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42P60953 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42P60953 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42P60953 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42P60953 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42P60953 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42P60953 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDC42P60953 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42P60953 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42P60953 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42P60953 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42P60953 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42P60953 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42P60953 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42P60953 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42P60953 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42P60953 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42P60953 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42P60953 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42P60953 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms