Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVPABLB-1P60509 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVPABLB-1P60509 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVPABLB-1P60509 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVPABLB-1P60509 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVPABLB-1P60509 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms