Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP1A2P50993 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP1A2P50993 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A2P50993 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms