Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REG1BP48304 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REG1BP48304 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REG1BP48304 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
REG1BP48304 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REG1BP48304 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REG1BP48304 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REG1BP48304 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REG1BP48304 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REG1BP48304 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
REG1BP48304 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
REG1BP48304 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
REG1BP48304 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REG1BP48304 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG1BP48304 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG1BP48304 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG1BP48304 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG1BP48304 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG1BP48304 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG1BP48304 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG1BP48304 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REG1BP48304 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REG1BP48304 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REG1BP48304 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REG1BP48304 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REG1BP48304 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REG1BP48304 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REG1BP48304 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REG1BP48304 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REG1BP48304 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REG1BP48304 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REG1BP48304 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REG1BP48304 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REG1BP48304 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REG1BP48304 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REG1BP48304 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REG1BP48304 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REG1BP48304 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
REG1BP48304 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REG1BP48304 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
REG1BP48304 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
REG1BP48304 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
REG1BP48304 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
REG1BP48304 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
REG1BP48304 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
REG1BP48304 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
REG1BP48304 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
REG1BP48304 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
REG1BP48304 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REG1BP48304 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REG1BP48304 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REG1BP48304 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
REG1BP48304 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REG1BP48304 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REG1BP48304 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REG1BP48304 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REG1BP48304 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REG1BP48304 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REG1BP48304 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REG1BP48304 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REG1BP48304 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
REG1BP48304 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REG1BP48304 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REG1BP48304 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REG1BP48304 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REG1BP48304 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REG1BP48304 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REG1BP48304 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REG1BP48304 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG1BP48304 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.2 ms