Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA2P48052 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA2P48052 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA2P48052 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA2P48052 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA2P48052 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA2P48052 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA2P48052 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA2P48052 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA2P48052 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA2P48052 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA2P48052 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA2P48052 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA2P48052 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA2P48052 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA2P48052 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA2P48052 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA2P48052 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA2P48052 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA2P48052 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA2P48052 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA2P48052 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA2P48052 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA2P48052 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA2P48052 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA2P48052 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA2P48052 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA2P48052 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPA2P48052 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA2P48052 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA2P48052 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA2P48052 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA2P48052 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA2P48052 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA2P48052 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA2P48052 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA2P48052 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA2P48052 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA2P48052 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA2P48052 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA2P48052 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA2P48052 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA2P48052 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA2P48052 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA2P48052 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA2P48052 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA2P48052 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA2P48052 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA2P48052 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA2P48052 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA2P48052 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA2P48052 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA2P48052 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA2P48052 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA2P48052 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA2P48052 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA2P48052 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA2P48052 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA2P48052 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA2P48052 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA2P48052 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA2P48052 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA2P48052 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA2P48052 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA2P48052 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA2P48052 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA2P48052 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA2P48052 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA2P48052 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA2P48052 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA2P48052 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA2P48052 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA2P48052 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA2P48052 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA2P48052 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA2P48052 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA2P48052 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA2P48052 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA2P48052 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA2P48052 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA2P48052 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA2P48052 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA2P48052 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA2P48052 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA2P48052 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA2P48052 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA2P48052 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA2P48052 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA2P48052 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA2P48052 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA2P48052 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms