Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDKN1BP46527 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKN1BP46527 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDKN1BP46527 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms