Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECI1P42126 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECI1P42126 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECI1P42126 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECI1P42126 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECI1P42126 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECI1P42126 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECI1P42126 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECI1P42126 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECI1P42126 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECI1P42126 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECI1P42126 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECI1P42126 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECI1P42126 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECI1P42126 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECI1P42126 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECI1P42126 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ECI1P42126 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ECI1P42126 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ECI1P42126 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ECI1P42126 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECI1P42126 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ECI1P42126 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECI1P42126 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECI1P42126 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ECI1P42126 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ECI1P42126 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECI1P42126 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECI1P42126 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECI1P42126 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECI1P42126 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECI1P42126 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ECI1P42126 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECI1P42126 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECI1P42126 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ECI1P42126 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECI1P42126 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECI1P42126 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECI1P42126 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ECI1P42126 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ECI1P42126 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ECI1P42126 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ECI1P42126 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECI1P42126 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECI1P42126 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECI1P42126 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECI1P42126 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECI1P42126 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECI1P42126 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ECI1P42126 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ECI1P42126 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECI1P42126 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECI1P42126 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECI1P42126 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ECI1P42126 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECI1P42126 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ECI1P42126 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECI1P42126 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECI1P42126 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECI1P42126 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECI1P42126 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECI1P42126 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECI1P42126 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ECI1P42126 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECI1P42126 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECI1P42126 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECI1P42126 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ECI1P42126 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECI1P42126 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECI1P42126 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECI1P42126 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECI1P42126 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECI1P42126 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ECI1P42126 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECI1P42126 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECI1P42126 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECI1P42126 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECI1P42126 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECI1P42126 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ECI1P42126 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECI1P42126 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECI1P42126 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms