Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN4P29074 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN4P29074 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN4P29074 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN4P29074 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN4P29074 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN4P29074 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN4P29074 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN4P29074 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN4P29074 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN4P29074 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN4P29074 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms