Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100A1P23297 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100A1P23297 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100A1P23297 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100A1P23297 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100A1P23297 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100A1P23297 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100A1P23297 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100A1P23297 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100A1P23297 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100A1P23297 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100A1P23297 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
S100A1P23297 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
S100A1P23297 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
S100A1P23297 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
S100A1P23297 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100A1P23297 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100A1P23297 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100A1P23297 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100A1P23297 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100A1P23297 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100A1P23297 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100A1P23297 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100A1P23297 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100A1P23297 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100A1P23297 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100A1P23297 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100A1P23297 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100A1P23297 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100A1P23297 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
S100A1P23297 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
S100A1P23297 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
S100A1P23297 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
S100A1P23297 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
S100A1P23297 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
S100A1P23297 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
S100A1P23297 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
S100A1P23297 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
S100A1P23297 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
S100A1P23297 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
S100A1P23297 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
S100A1P23297 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
S100A1P23297 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
S100A1P23297 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
S100A1P23297 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
S100A1P23297 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
S100A1P23297 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
S100A1P23297 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
S100A1P23297 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
S100A1P23297 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
S100A1P23297 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
S100A1P23297 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
S100A1P23297 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
S100A1P23297 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
S100A1P23297 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
S100A1P23297 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
S100A1P23297 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
S100A1P23297 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
S100A1P23297 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
S100A1P23297 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
S100A1P23297 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
S100A1P23297 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
S100A1P23297 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
S100A1P23297 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
S100A1P23297 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
S100A1P23297 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
S100A1P23297 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
S100A1P23297 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
S100A1P23297 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
S100A1P23297 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
S100A1P23297 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
S100A1P23297 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
S100A1P23297 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
S100A1P23297 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
S100A1P23297 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
S100A1P23297 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
S100A1P23297 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
S100A1P23297 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
S100A1P23297 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
S100A1P23297 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
S100A1P23297 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
S100A1P23297 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
S100A1P23297 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
S100A1P23297 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
S100A1P23297 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
S100A1P23297 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
S100A1P23297 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
S100A1P23297 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
S100A1P23297 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
S100A1P23297 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
S100A1P23297 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
S100A1P23297 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
S100A1P23297 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
S100A1P23297 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
S100A1P23297 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
S100A1P23297 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
S100A1P23297 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
S100A1P23297 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
S100A1P23297 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
S100A1P23297 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms