Protein–RNA interactions for Protein: P0C881

RSPH10B, Radial spoke head 10 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10BP0C881 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH10BP0C881 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH10BP0C881 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH10BP0C881 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH10BP0C881 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH10BP0C881 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms