Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYNP07948 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYNP07948 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LYNP07948 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYNP07948 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYNP07948 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYNP07948 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYNP07948 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYNP07948 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYNP07948 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYNP07948 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYNP07948 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNP07948 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNP07948 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNP07948 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNP07948 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNP07948 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNP07948 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNP07948 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNP07948 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYNP07948 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYNP07948 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYNP07948 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYNP07948 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYNP07948 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYNP07948 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LYNP07948 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYNP07948 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LYNP07948 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYNP07948 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYNP07948 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYNP07948 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYNP07948 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYNP07948 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYNP07948 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYNP07948 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYNP07948 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYNP07948 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYNP07948 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYNP07948 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LYNP07948 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LYNP07948 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LYNP07948 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYNP07948 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYNP07948 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYNP07948 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYNP07948 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYNP07948 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYNP07948 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYNP07948 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYNP07948 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYNP07948 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYNP07948 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYNP07948 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYNP07948 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYNP07948 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYNP07948 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYNP07948 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYNP07948 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYNP07948 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYNP07948 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYNP07948 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LYNP07948 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYNP07948 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYNP07948 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYNP07948 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYNP07948 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYNP07948 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYNP07948 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYNP07948 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYNP07948 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYNP07948 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYNP07948 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYNP07948 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYNP07948 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LYNP07948 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYNP07948 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYNP07948 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYNP07948 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYNP07948 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYNP07948 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYNP07948 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYNP07948 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYNP07948 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYNP07948 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYNP07948 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYNP07948 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYNP07948 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYNP07948 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYNP07948 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYNP07948 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYNP07948 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYNP07948 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYNP07948 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYNP07948 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYNP07948 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYNP07948 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYNP07948 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYNP07948 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYNP07948 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms